Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms