Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp31E9Q6Y8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp31E9Q6Y8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Usp31E9Q6Y8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Usp31E9Q6Y8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Usp31E9Q6Y8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Usp31E9Q6Y8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Usp31E9Q6Y8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Usp31E9Q6Y8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Usp31E9Q6Y8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms