Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Simc1E9Q6E9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms