Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm17175E9Q528 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm17175E9Q528 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm17175E9Q528 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm17175E9Q528 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm17175E9Q528 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm17175E9Q528 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm17175E9Q528 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm17175E9Q528 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17175E9Q528 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm17175E9Q528 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm17175E9Q528 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm17175E9Q528 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17175E9Q528 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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