Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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