Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hectd4E9Q2E4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms