Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms