Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms