Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms