Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms