Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx60E9PZQ1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms