Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ryr1E9PZQ0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms