Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms