Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms