Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms