Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms