Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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BC035044E0CXF8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC035044E0CXF8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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