Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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