Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms