Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms