Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cttnbp2B9EJA2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms