Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms