Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms