Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clrn2B2RVW2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clrn2B2RVW2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms