Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms