Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc8B2RUS7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abcc8B2RUS7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms