Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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