Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtprbB2RU80 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtprbB2RU80 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtprbB2RU80 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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PtprbB2RU80 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprbB2RU80 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprbB2RU80 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprbB2RU80 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PtprbB2RU80 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PtprbB2RU80 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PtprbB2RU80 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PtprbB2RU80 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PtprbB2RU80 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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