Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms