Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms