Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms