Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms