Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd5B1AYB6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms