Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxa1B1AUS7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxa1B1AUS7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxa1B1AUS7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxa1B1AUS7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxa1B1AUS7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssxa1B1AUS7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssxa1B1AUS7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms