Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms