Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint5A7XUY5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint5A7XUY5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms