Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms