Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms