Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll11A4Q9F4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms