Protein–RNA interactions for Protein: A3KGK3

Fer1l4, Fer-1-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fer1l4A3KGK3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fer1l4A3KGK3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms