Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm6880A3KG45 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm6880A3KG45 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm6880A3KG45 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm6880A3KG45 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm6880A3KG45 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm6880A3KG45 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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