Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Atp8b5A3FIN4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Atp8b5A3FIN4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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Atp8b5A3FIN4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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