Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trgv2A2J008 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms