Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms