Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms