Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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