Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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