Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3aA2AIR5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin3aA2AIR5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms