Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms