Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms